Slezskou diakonii vede od konce roku 2010 paní ředitelka Mgr. Zuzana Filipková, Ph.D. Společně s ní řídí důležité oblasti života Slezské diakonie dva náměstci – náměstek pro sociální práci paní Mgr. et Ing. Romana Bélová a provozně ekonomický náměstek pan Ing. Bronislav Kostka.
Střediska Slezské diakonie nemají samostatnou právní subjektivitu. Jsou řízena centrálně Ústředím Slezské diakonie, které se nachází ve třech budovách v Českém Těšíně. První z nich - „Ústředí A“ se nachází na ulici Na Nivách 7. Druhá budova - „Ústředí B“ je na ulici Dukelská 264. Třetí budova - "Ústředí C" je na ulici Dukelská 263.
Práce na Ústředí Slezské diakonie je rozdělena do odborů a sekcí, které se soustřeďují na oblasti potřebné pro fungování Slezské diakonie jako celku.
Představenstvo Slezské diakonie
Představenstvo na svých jednáních řeší přípravu Shromáždění SD a stěžejní otázky provozu Slezské diakonie. Jedná se zejména o kontrolu a hodnocení hospodaření a činnosti organizace, personální otázky, správnost složení a činnost představenstev oblastí.
Tabulka členů představenstva Slezské diakonie
| jméno | funkce | zaměstnání | |
| Arnold Macura | předseda | ředitel POLNACORP | |
| Mgr. Zuzana Filipková, Ph.D. | místopředseda | ředitel Slezské diakonie | |
| Ing. Česlav Santarius | místopředseda | Historická společnost HEREDITAS z.s., místopředseda | |
| Ing. Mgr. Romana Bélová | člen | náměstek ředitele Slezské diakonie | |
| Mgr. Roman Brzezina | člen | pastor FS Bohumín SCEAV, senior Ostravsko-karvinského seniorátu | |
| Bc. Marta Czyžová | člen | místokurátorka církve SCEAV | |
| Vanda Stanieková | člen | ||
| Lumír Svoboda | člen | operátor - vedoucí stavební údržby, OKD - SC | |
| Mgr. Lenka Waszutová, MBA | člen | vedoucí Sekce řízení lidských zdrojů, tiskový mluvčí, Slezská diakonie | |
| Ing. Jiří Ziętek, MBA | člen | Třinecké Gastroslužby, jednatel | |
| Ing. Mgr. Jiří Kaleta | člen | koordinátor Slezské diakonie, OÁZA Nebory |
Představenstva oblastí
V jednotlivých oblastech SD působí představenstva oblastí, která plní roli poradního orgánu řízení a správy těchto oblastí. Níže uvádíme seznam zástupců v jednotlivých Představenstev oblastí:
Představenstvo oblasti Bruntál, Krnov
- Ing. Mgr. Petr Chromčák - ředitel MŠ, ZŠ a SŠ Slezské diakonie Krnov
- Petr Světlík - ředitel sociálního podniku Chrpa Krnov
- Ing. Ludmila Vajdová - vedoucí Oblasti Krnov, Bruntál
- Martin Litomiský - farář ČCE Krnov
- MVDr. Pavla Löwenthalová - členka zastupitelstva města Krnova
- Ing. Milan Swider - sociální pracovník střediska Slezské diakonie Bethel Bruntál
- Renáta Skulinová - koordinátorka střediska Slezské diakonie NOE Krnov, Bruntál
Představenstvo Oblasti Novojičínsko
- Lhotská Gabriela, DiS.
- Mgr. Pavel Prejda
- Mgr. Antonín Urban
- Bc. Vít Raška
- p. Lenka Budová
- Ing. Alena Kukuczová
- Mgr. Dagmar Pospěchová
Představenstvo Oblasti Karvinsko
- Mgr. Witold Strumpf (předseda)
- Ing. Bc. Milana Bakšová (místopředsedkyně)
- Mgr. Emil Macura
- Iveta Kuczerová
- Bc. Iveta Pastuszková
- Mgr. Martina Bystroňová
- Ing. Ondřej Brdíčko
- Pavla Matušínska
- Richard Borecki
Představenstvo Oblasti Ostravsko
- Mgr. Vilém Szlauer (předseda)
- Bc. Renáta Motyková Dis.(místopředsedkyně)
- Mgr. Janusz Kożusznik
- Mgr. Roman Brzezina
- Mgr. Natálie Klusová
- Jan Kubiš
- Mgr. Pavel Taska
- Pastor Jiyun Jang
Představenstvo Oblasti Frýdek-Místek, Třinec
- Arnold Macura (předseda)
- Petr Wiselka (místopředseda)
- Mgr. Miroslav Sikora
- Marie Bornerová
- Emil Gryga
- Ing. Michael Trojka
- Vladislav Blahut
- Ing. František Kufa
Představenstvo Oblasti Těšínsko
- Zbyšek Michnik - předseda
- Dagmar Siudová
- Radek Wantulok
- Vanda Stanieková
- Lucie Haroková
- Jana Chlebusová
- Tomasz Gierczuszkiewicz
- Dagmar Bystroňová - místopředseda
Představenstvo Oblasti Pobeskydí
- Benjamín Andrýsek, student
- Mgr. Renata Firlová, pastor SCEAV Komorní Lhotka
- Ing. David Harok, starosta obce Chotěbuz
- Bc. Lenka Josieková, sociální pracovnice
- Bc. Urszula Klusová, zubní instrumentářka
- Mgr. Lenka Mencnerová, středisko TABITA Český Těšín, Třinec, Třanovice, Jablunkov
- Mgr. Roman Raszka, pastor SCEAV Návsí, senior Jablunkovský seniorát
- Bc. Aneta Siwá, středisko SAREPTA Komorní Lhotka
- Ing. Jaroslav Szromek, jednatel Tring Invest, s.r.o.
- Mgr. Halina Pientoková, DiS., vedoucí oblasti Pobeskydí